一群来自美国疾控中心的科学家前往位于北极圈内的高科技实验室「北极生物系统」（ArcticBioSystems）研究基地调查有几率发生的疾病爆发事件。他们很快发现了自己陷入一场生死危局，而他们的发现对于拯救人类免遭灭绝厄运至关重要。他们的遭遇只是这起事件的冰山一角，随着病毒的快速进化，惊人的真相开始浮出水面。

  当Alan Farragut医生和他的团队治疗被黑胶病毒感染的患者并竭力控制病毒的传播时，「北极生物系统」研究基地里发生一起叛乱事件。

  CDC团队期望病毒已得到控制，不幸的是，病毒仍然在迅速传播。与此同时，事实上这些医生们保守的某些秘密是相当致命的。

  基地里的危机加剧，Julia Walker在R层竭力求生，一个戴防毒面具的神秘人救了她一命。与此同时，调查组内部开始相互猜忌——因为他们每个人都有不可告人的秘密！

  基地里人全都相互猜忌，慢慢的变多的人死去。小组成员开始意识到任何一个人都戴着假面具，任何一个人都有不可告人的秘密。

  Alan和Jordan在破译病毒密码方面取得重大进展。Hatake在公司的黑色直升机抵达研究基地之前偷偷「治愈」了Walker。

  Daniel有了一个新的发现。Hatake保护Walker不受Sutton的雇佣兵的伤害。一个与北极生物系统实验室有关的黑暗秘密曝光，而病毒存在的真实目的也会得到解释。某个角色在基地之外找到了不靠谱的盟友。

  秘密开始曝光，不靠谱的联盟关系正式形成。与此同时，Alan和Walker决定从事一项危险的任务以摧毁剩余的NARVIK病毒。

  Alan和Walker来到一处被废弃的卫星接收站，为寻求救援做最后的努力。他们在那里发现了隐藏在Hatake的计划背后的真相。与此同时，Jordan医生也有了一个惊人的发现--那可能是治疗癌症的药物。

  Peter领导病毒携带者为传播病毒做出最后的努力，而疾控中心的科学家们决心团结一致。虽然生命受到Ilaria公司的雇佣兵的威胁，但他们还是成功创造出一种病毒解药。

  Ilaria派遣一名可怕的刺客取回病毒和解药，Alan、Walker、Hatake和Daniel决定设下一个陷阱来对付此人。

  肆虐北极生物系统基地（Arctic Biosystems）的致命病毒被Peter偷偷带出基地，Peter正私下与伊拉里亚公司（IlariaCorporation）合作。病毒在波多黎各引发大面积感染。「镰刀」（TheScythe）带Jules逃走，途中还杀害了Jules的母亲，但Alan在离开基地前拿到了一个小罐子，里面可能装着解药。222天之后，Alan仍然在寻找Jules。他哪里知道，Jules此刻正在伊拉里亚公司的巴黎总部主持一个重要会议。疾控中心团队已经回到了美国本土，但他们仍然没有忘记纳尔维克（Narvik）北极生物研究基地病毒大爆发事件所造成的难以处理的后果。不久之后，一艘豪华帆船游轮上再次爆发可疑的病毒感染事件，Alan、Peter、Julia、Sarah和研究小组的其他人再次启程奔赴现场展开调查。根据所掌握的线索，研究小组找到一座神秘的岛屿（圣哲曼岛）。岛上居住着一个与世隔绝的异教团体，他们在这里创造出一个乌托邦社会。研究小组很快意识到，这座看似平静的小岛上暗流涌动，一股黑暗的力量随时有可能爆发。

  当疾控中心团队继续调查这座神秘的小岛时，一个患病的孩子忽然出现。孩子奇迹般地康复，Jordan怀疑这件事并不简单。与此同时在未来，Walker和Caleb掘开Alan的坟墓，他们的发现加重了这座岛的神秘色彩。Peter的兄弟Alan是Michael的异教组织的一名成员。Alan警告众人离开修道院，但没有人听他的。

  Jordan和Peter决定冒险到修道院外走一趟——既是为了采集一些样本，也还是为了调查隐藏在树林中的真相。与此同时，Amy修女密谋将急救中心团队彻底赶走。

  Michael试图控制修道院的局势，而疾控中心团队距离病原体的源头已经慢慢的接近。Alan极其渴望重新加入自己的团队，但又不得不面对Peter的忠诚不再可靠这个现实，这令他内心非常痛苦。在未来，Walker不顾一切地想要逃离患妄想症的父亲，但那可能带来致命的后果。

  Michael将Peter和Alan锁在一个洞里，Alan逃出去后发现了Kyle隐瞒的一个秘密。Agnes向Michael说出了一个令人震惊的真相。Agnes对Michael的怀疑令Michael颇感愤怒。在未来，Caleb发现了Walker的阴谋诡计，他决定亲自来处理此事。Kyle忙于隔离果园和受感染的蜂巢。

  Agnes死后，Amy创造出一种流行病毒并使之扩散，而Michael在洞穴里不停折磨Peter。Alan、Jordan和Kyle发现修道院里食物供应链被污染的真相，但Alan被药物控制，竟对Jordan发动攻击。修道院里，威胁到未被感染者的安全。与此同时，在现代巴黎，Walker召唤了Balleseros。她受到指引与一个不靠谱的永生者相见，对方可能掌握着她的任务成败的关键。

  修道院里的情况已经失去控制，Michael打算实施代号“Thinning”的大规模自杀行动。Amy指控Michael这是要搞谋杀，但她很快发现他有一个更加可怕的计划：他要利用她作为“重新殖民”的“孩子制造工厂”。当Alan和Kyle寻找Jordan时，Alan通过回忆想起自己曾对昏迷中的Jordan做过一次可怕的手术。Peter发现Anne和自己一起被困在地下秘牢中，共同的遭遇令他们的关系变得亲密起来。与此同时，Walker遇到一个10岁大的不死之人，对方将Michael在圣杰曼（St. Germain）实施的计划告诉了她。Walker决定亲自前往圣杰曼。

  Michael的行动带来灾难性后果，疾控中心团队尚未恢复元气，海岸警卫队又带来了另一个坏消息——新一轮病毒大爆发出现了。与此同时，因为遭到囚禁而被彻底激怒的Amy控制了修道院，将Michael关进地洞。Jordan相信自身的孩子还活着，于是将「永生」的真相告诉了Kyle以寻求他的帮助。在未来，Walker继续寻找失踪的Hatake之剑，她在修道院的秘密中陷得更深了。

  Alan、Kyle和Winger搜遍整个树林寻找有红色树液的那棵树，那是治愈病菌的唯一希望。

  在修道院里，Amy修女为获得永生而达成一项协议。在树林里，人们继续寻找“血树”（Bleeding Tree）。现在Kyle也感染了，他们的行动必须加快速度。

  马里兰贝塞斯达国家灵长类动物研究中心里，实验正在进行。工作人员最新研制的化合物在短时间内大量生产是很难做到的，而他们却意外做到了。

  Peter还未消失只是以Eli的身份存在着，这给岛屿上一部分人的安全带来了威胁。Kyle和Sarah逃避Peter的追捕。在逃亡的过程中Sarah的儿子出了些状况，为此Sarah执意返回实验室。

  Alan严重受伤，鲜血直涌。Kyle在疾控中心请求救援，声称有真菌病的解药。大家正在想办法逃离这个岛，因为待得越久，病菌感染的几率越高。